Транспортный переулок проходит от Лиговского проспекта до Днепропетровской улицы. С 1798 года это был Чубаров переулок. Название его велось по фамилии домовладельца, ямщика Кобыльей (Ямской) слободы.

Фото Алексея Фёдорова. Источник фото - https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Transportny_Lane_SPB.jpg

В 1821–1844 годах параллельно употреблялось название Моховой переулок по пересекавшей его Моховой Каретной улице (ныне улица Черняховского), а на плане 1828 года переулок обозначен как Хмелёв, тоже, вероятно, по фамилии домовладельца.10 сентября 1935 года его переименовали в Транспортный, в связи с тем, что переулок расположен вблизи главного хода Октябрьской железной дороги. Небезынтересно отметить, что этим постановлением 1935 года в основном переименовывались проезды с дублирующимися названиями.

Чубаров переулок был единственным, выпадавшим из этого ряда. Его переименование связано с тем, чтобы название вызывало ассоциации с «чубаровцами», как прозвали группу преступников, совершавших изнасилования и убийства в этом переулке в 1926 году. По «чубаровскому делу», вызвавшему широкий общественный резонанс и негодование среди горожан, проходило более двадцати человек.